柴油发电机持续工作，会产生大量的热量，过热的工作温度极易导致发电机组发生故障，且缩短机组的使用寿命，所以一套完整的发电机组一定会有散热器保证机组的正常运行。一般常用的冷却方法有以下两种：

一、联机式散热器

当散热器装于发动机尾端，机组定位应使散热器尽可能靠近排气口，否则可能产生的热空气回流，建议散热起离出口最大的距离为150mm。

若此发电机组不能按上述方法定位，则必须在系统中设计一条排风槽。该风槽的最小截面面积必须与散热器的冷却面积相等，一般可采用一条配有钢制法兰以便连接散热器及排风百叶的帆布风槽。风槽的弯头必须为完好的半径如需长流程管道，则管道的界面面积必须放大以降低散热器的背压。

二、远置散热器冷却系统

在平面以下安装的发电机组，空间限制了风槽的运用，但可采用其他冷却方法。远置散热器冷却系统中散热器是与发动机分开的，并由电动风机做散热之用，此系统可作为一个全封闭的单元组件供户外使用，亦可做开放形式供室内装置用。

当散热器安装于高于机组3米以上时，大多数发动机要求装一个分置的水箱和电动水泵，分支水箱的尺寸取决于整个冷却系统的容量，即需要的管道总量加上冷却水用量。冷却水由一台电动循环泵带动，从分置水箱经过散热器和发动机进行循环。一般散热风机和水泵马达由发电机组供电，此部分需用负载功率应计入总的发电机组功率。

当机组处于停用状态，此时水将从散热器流入分置水箱，而当机组在运行中，此分置水箱必须具有足够的水以充满全部冷却系统，并长期保持足够的冷却水。以确保有效的循环。